经期不能性交的第一个理由，是预防生殖系统感染。妇女月经来潮时子宫内膜（子宫里边那一层组织）一块块地向下剥离脱落。经期性交时，很容易将外阴及会阴（阴道口与肛门之间的部位）周围的病菌带入阴道、子宫颈以至进入子宫，细菌正好在有血的地方生长和繁殖，就地发生炎症，叫做子宫内膜炎，不仅出现发烧、下腹痛，而且月经流血增多，月经期延长。如果感染的细菌毒力很强，还可能通过子宫内膜的淋巴管扩散到子宫外边，进入盆腔，引起急性附件炎（包括输卵管及卵巢）及盆腔腹膜炎，那就不仅仅发烧腹痛了，还可能影响到以后的生育。输卵管一旦发炎即可发生粘连，重则管腔闭塞，精子不能通过则不能受孕。

经期不能性交的第二个理由，是预防发生子宫内膜逆流入盆腔引起子宫内膜异位症（正常情况下子宫内膜在经期是随月经血流到外边来的）。如经期性交，当女方兴奋达到高峰的时候，子宫要发生收缩，此时已脱落在子宫腔的内膜碎块即可随子宫收缩的压力而进入输卵管，沿输卵管进入腹腔、盆腔，无论落到哪一个地方就地生长，均发生子宫内膜异位症。此病可以引起输卵管与子宫、盆腔发生粘连，也能引起卵巢表面肥厚以及发生血液贮留，既可破坏正常的卵子的发育成长，也影响排卵，所以最后也会造成不孕。因此经期不宜性交。